การผ่าตัดสมอง  เป็นการผ่าตัดที่ต้องคำนึงถึงความปลอดภัยอย่างสูง  ความผิดพลาดแม้เพียงเล็กน้อยก็อาจส่งผลแทรกซ้อนต่อผู้ป่วย  บางครั้งทุพพลภาพหรือเป็นอันตรายถึงชีวิตได้  ถึงแม้การผ่าตัดในปัจจุบันนี้  จะมีอุปกรณ์มากมายตลอดทั้งการใช้กล้องผ่าตัดที่มีกำลังขยายสูง  เพื่อช่วยให้การผ่าตัดมองเห็นได้ชัดเจนขึ้น  ทำให้ผลการผ่าตัดในปัจจุบันนี้ได้ผลเป็นที่น่าพอใจกว่าการผ่าตัดในอดีตอย่างมาก  อย่างไรก็ตาม  การผ่าตัดในสมองบางตำแหน่ง เช่น ความผิดปกติในสมองส่วนที่ลึกลงไปจากผิวสมอง  หรือความผิดปกติในสมองที่มีขนาดเล็กๆ  การทำผ่าตัดในกรณีนี้ถ้าไม่มีอุปกรณ์ที่จะช่วยบอกตำแหน่งในระหว่างทำผ่าตัด  จะทำให้การผ่าตัดทำได้ยากลำบาก หรือในบางครั้งไม่สามารถทำผ่าตัดได้  เพราะอาจจะเกิดการผิดพลาดระหว่างผ่าตัดเนื่องจากการพลาดเป้าหมาย  ซึ่งอาจจะส่งผลเสียอย่างร้ายแรงต่อผู้ป่วย
ในปัจจุบันนี้มีอุปกรณ์ที่เรียกว่า  Neuronavigator  (รูปภาพที่ 1) ซึ่งมีประโยชน์ในการผ่าตัดสมอง  อุปกรณ์นี้สามารถบอกพิกัดของตำแหน่งต่างๆ ในสมองได้อย่างแม่นยำ  ทำให้การผ่าตัดสมองแม้ความผิดปกติจะอยู่ในตำแหน่งที่ลึกของสมอง  หรือที่มีขนาดเล็กๆก็ตาม  ศัลยแพทย์ทางสมองก็สามารถทำผ่าตัดเข้าไปถึงความผิดปกติได้อย่างแม่นยำ